内蒙古呼伦贝尔微生物菌种在厌氧生物处理的过程中，复杂的有机化合物被分解，转化为简单、内蒙古呼伦贝尔稳定的化合物，同时释放能量。该过程也称为厌氧消化或甲烷发酵，指在厌氧微生物的作用下，有控制地使废物中可生物降解的有机物转化为甲烷、内蒙古呼伦贝尔本地二氧化碳和稳定物质的生物化学过程。 [3]其中，大部分的能量以甲烷的形式出现，这是一种可燃气体，可回收利用。同时仅少量有机物被转化而合成为新的细胞组成部分，故相对好氧法来讲，厌氧法污泥增长率小得多。好氧法因为供氧限制一般只适用于中、内蒙古呼伦贝尔当地低浓度有机废水的处理，而厌氧法既适用于高浓度有机废水，又适用于中、内蒙古呼伦贝尔同城低浓度有机废水。同时厌氧法可降解某些好氧法难以降解的有机物，如固体有机物、内蒙古呼伦贝尔当地着色剂蒽醌和某些偶氮染料等。